Aquí un pequeño script para hacer respaldos sincronizados con RSync entre solamente dos directorios, si se necesita más, se puede adaptar a las necesidades que tengamos.

dirA = Directorio que queremos respaldar
dirB = Directorio destino

Las opciones que interesantes son:
–no-whole-file: Con esto, revisaremos que el archivo tenga diferencias, si es asi, se copia.
–delete: Se elimina del destino, si en el origen no existe.

#!/bin/bash
echo -e "Comenzando Respaldo"
rsync -av --no-whole-file --delete /dirA/ /dirB/